零点小说网

手机浏览器扫描二维码访问

767锁定(第2页)

基于这一特点,10×GenomicsChromium平台同时测序数千个细胞。

与Smart-seq2等低通量方法相比,10×GenomicsChromium平台因其成本低、效率高而被更广泛地应用于B细胞检测。

在对多种scRNA-seq方法的比较研究中,10×Genomics也比其他高通量方法如Drop-seq和Indrops[33]具有更高的灵敏度,更高的与线粒体基因匹配的reads比例,更低的噪声。

利用10×Genomics和Smart-seq2平台,可以通过不同的免疫球蛋白重链特征区分CRC中B细胞的亚群,聚类结果无明显差异。

但是,10×Genomics也有不足之处,它不能覆盖所有的基因,并且存在3区域偏倚,在检测基因突变或mRNA剪接位点时可能会遗漏一些重要信息。

此外,这种方法对细胞质量有更高的要求,不同的组织和不同的获取样本的方法都不同。

利用scRNA-seq,我们可以更精确地定义细胞的亚型,追踪它们的发育谱系,确定克隆型和表现型之间的关系,绘制不同细胞之间的相互作用和空间关系图,从而从多个维度描述TME。

此外,还需要通过一系列体内和体外实验来验证结果。

我们总结了使用scRNA-seq研究的最新出版物

B细胞受体(Bcellreceptor,BCR)是一种能识别并结合特异性抗原的膜免疫球蛋白,在B细胞的分化成熟过程中起着重要作用。

BCR由两条重链和两条轻链组成,其中可变(V)、多样性(D)和连接(J)基因序列的重组创造了B细胞的多样性。

这种多基因的复杂性使得鉴别不同的受体变得困难。

然而,由于每个B细胞通常表达一个单一的受体,潜在的抗原特异性受体可以通过给定的原细胞链发现。

BCR的两个主要功能如下。

首先,它通过诱导B细胞激活过程中肌动蛋白骨架的实质改变和各种基因的表达来激活B细胞。

其次,它介导抗原的鉴定和提取,从而导致加工过的肽在主要组织相容性复合体II(MHCII)上呈现给T辅助细胞。

因此,BCR测序有助于进一步了解B细胞分化的轨迹及其特异性识别抗原性的机制,特别是当与单个B细胞的完整转录组身份配对时,这为了解癌症的发展提供了线索。

更重要的是,BCR测序可以追踪来自单细胞的群体,揭示克隆型和表型之间的关系。

ScRNA-seq技术在BCR测序中具有天然优势,因为含有UMI的微流控系统可以保证同源VH-VL配对的保存,而这些同源VH-VL配对在B细胞批量测序中可能会丢失。

BASIC是一个在单细胞分辨率上进行BCR测序的平台。

作为重建配对全长BCR序列的工具,BraCeR为B细胞的克隆推断和谱系追踪提供了一个完整的管道。

LIBRA-seq是一种高通量的方法,将BCRse-序列与其同源抗原特异性连接起来,可以用来绘制特定对象中数千个B细胞的抗原特异性。

研究免疫球蛋白以探讨体液免疫的复杂性

免疫球蛋白存在于肿瘤和血清中,在肿瘤中起双重作用。

抗体通过其片段可结晶(Fc)支配功能,并受翻译后修饰调控。

通常,免疫球蛋白是由骨髓和脾脏的浆细胞(PCs)分泌的。

组织炎症区域和肿瘤内部的pc,特别是在三级淋巴结构(TLS)中,分泌肿瘤相关抗体并直接在肿瘤上诱导原位效应。

在抗肿瘤功能方面,IgG是最重要的一类人免疫球蛋白,因为它能够结合巨噬细胞和自然杀伤细胞上的Fcγ受体,并促进、ADCP和CDC的作用。

此外,IgG对抗原处理和呈递至关重要,因为抗原呈递细胞(APCs)上的Fcγ受体可以与IgG包被的免疫复合物结合,激活T细胞。

抗体和抗体分泌细胞(APCs)的单细胞测序有助于进一步明确B细胞体液免疫的复杂网络。

已经报道了一种单细胞液滴微流控测序方案,用于特异性结合靶细胞的抗体,这也适用于初级人类是一种液滴微流体系统,用于高通量单细胞筛选分泌IgG的原代细胞,一方面,通过基于荧光的液滴内单细胞生物测定检测IgG活性,另一方面,用反转录对配对的V基因进行测序。

热门小说推荐
大明首富级皇帝

大明首富级皇帝

听我一句劝,千万不要当皇帝,当皇帝太累了,简直不是人干的事,我发誓如果我想当皇帝,我永生都是皇帝!不信我以吟诗一首以明志!穿衣戴甲手持兵成王败寇已无意皇者之路千般血帝途终是一场空真龙天子我独尊踏骨扬灰谁人敌马上称雄万臣服爽看回首却独一苦!苦啊对了有人会开055吗?或者052d也行啊?赶紧穿过来,朕派一千锦衣卫十二个时辰呈球形贴身保护,绝不砍死你!我保证!我发四!...

纵古横今

纵古横今

今人穿越到古代,各种王侯霸业!古人穿越到现代,又能创造出什么传奇?...

乡野神医俏婆娘

乡野神医俏婆娘

作者鸭霸的经典小说乡野神医俏婆娘最新章节全文阅读服务本站更新及时无弹窗广告小说落魄小伙摇身一变成乡野小神医,治治病,喝喝茶,闲聊时来带领乡村致富,本是咸鱼医生。。。。...

时光微苦你独甜

时光微苦你独甜

新文开坑啦,还请多多指教吖上帝给予每个人以相对的公平。她,金翎儿,活泼开朗,多才多艺,M国邺城首富南宫家的掌上明珠,因4岁时与异瞳小哥哥经历一次绑架,被过度保护,成年后与父亲约定,来到邻城虞城圣皇蒂娜大学读书。他,夜煌,为人冷酷,6岁流落孤儿院,遭绑架后被外公寻回,却失去了味蕾,于他世上万般皆苦,16岁创立夜暗阁,18岁获得S国金融和理工双学位,帝夜总裁,20岁回M国虞城接受家族事业,并受邀成为...

山神在都市

山神在都市

赘婿林南因意外融合了一枚山神神格,本以为命运将会发生天翻地覆的变化,但当他看着眼前繁华的都市时,傻眼了。山都没了,当个山神还有个毛用啊。...

都市神医狂婿

都市神医狂婿

都市神医狂婿他,是让敌人闻风丧胆的地底世界统治者,是战友最可靠的医疗后盾。回归都市却遇到高冷女Boss,还必须结婚?苏薇!我的好老婆,你听我解释!好你个龙心泉,你不是医生吗?这算怎么回事!打流氓除恶霸快意恩仇,潇洒都市!...

每日热搜小说推荐